图书馆医学分馆前身为张掖卫校图书室，2003年升格为张掖医专图书馆，2014年整体并入河西学院，更名为河西学院图书馆医学分馆。馆舍面积12847平米，共有阅览座位1220个，周开馆超92.5小时。

自2015年以来，实行总分馆管理模式，采用“一门式”开放与藏、借、阅、咨一体服务，设有7个阅览厅室（医学类图书借阅厅2个、社科类图书借阅厅1个、文学类图书借阅厅1个、理工类图书借阅厅1个、电子阅览室1个）、4个学生自主学习室。截至2023年9月，现有纸质馆藏104544册，形成了以医学学科为主体，涵盖人文社会科学、理学、工学等学科的馆藏结构。馆内实现校园无线网络全覆盖，数字资源通过校园网共享访问，互联互通，满足24小时访问检索、查询下载服务。

近年来，馆内大力加强医学类特色馆藏的建设力度，加快推进资源专业化、服务智能化、管理科学化进程，在为医学校区读者提供方便快捷的文献服务的同时，不断满足医学学科教学科研发展与人才培养需求，为学校内涵建设与转型提升发展提供必需的文献服务保障。（2023年10月）