该系統提供院藏清代宮中檔奏摺、軍機處檔摺件、檔冊、大清國史人物列傳及史館檔傳包傳稿等清代文獻之後設資料（metadata）及影像圖檔，再加上與台湾中央研究院史語所合作建置之清代檔案人名權威等資料連結，以結構式呈現，藉以理解檔案生成之相關文獻脈絡；並因應新世代人文研究導向，以實踐人文研究新意涵，體現博物館數位典藏之重要前瞻性。

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甲、檔案

1. 宮中檔奏摺－主要為清代文武官員向皇帝報告公私事務的奏摺原件，內含康熙、雍正、乾隆、嘉慶、道光、咸豐、同治、光緒等朝之滿、漢文奏摺，計158,614件。

2. 軍機處檔摺件－主要包含自乾隆、嘉慶、道光、咸豐、同治、光緒至宣統等朝官員或相關衙門機構之奏摺抄件、附件、附圖、清單、清冊、咨文及在京官員直接歸入軍機處檔案之摺件等，計190,889件。

3. 軍機處檔冊－為軍機處官員抄存機關內部各式文書編輯裝釘而成之檔冊。依內容可分為（1）目錄類檔冊，如隨手登記檔、發繕摺件檔、交發檔等；（2）諭旨類檔冊，如上諭檔、寄信檔（含廷寄、剿捕廷寄）等，收錄清代皇帝對官員的指示紀錄；（3）專案類檔冊，帶有主題性抄錄而成的檔冊，如邊陲用兵為主題的邊備夷情檔、緬檔、安南檔、廓爾喀檔；鎮壓地方動亂主題的東案檔、林案供詞檔、川陝楚善後事宜檔、剿捕檔等；以及對國內少數民族用兵為主題的金川檔、苗匪檔、剿捕逆回檔等；（4）奏事類檔冊，如奏摺檔、議覆檔及月摺檔等，內容屬於抄錄議奏的檔冊；（5）記事類檔冊，屬於辦理事務內容之抄錄檔冊，如密記檔、引見檔；以及（6）文移電報類檔冊，如文移檔、收發電檔、各省電稿等，以上六類共包含56種檔冊，計6,218冊。

4. 內閣部院檔－為內閣六部辦理事務的檔案資料，內容有清代歷朝詔書、國書、外紀檔、絲綸簿、軍機檔、各科史書、實錄館調取現月檔收發簿、大清會典兵部稿本、御覽黃冊及滿文原檔（又稱舊滿洲檔）等，計2,027冊。

5.史館檔－內含紀、志、表、傳四大類。（1）院藏清代歷朝皇帝本紀（滿漢文本）稿本及黃綾定本共１,293冊；（2）專題性質的志書，包括天文志、災異志、時憲志、地理志、禮志、樂志、輿服志、儀衛志、選舉志、職官志、食貨志、河渠志、兵志、刑法志、藝文志、邦交志、國語志，計5,242冊；（3）清代王公大臣職官年表及表包，共1,039冊；（4）清代國史館或民初清史館本編纂之人物傳記稿本、傳包及長編總檔、總冊等，共15,397冊。

6. 雜檔－此類檔案內容繁雜，如清聖祖與羅馬使節關係文書、清高宗致荷蘭國王書信及賞物單、復辟文證、（錫良）電稿及奏稿、收照存根、大庫庫書檔等49種，計506冊（件）。

上述檔案，本院將以「件」為內容詮釋單位進行建置，其中「宮中檔奏摺」、「軍機處檔摺件」、史館檔之「傳稿」、「傳包」等類，總計約36萬餘件業已完成，目前正加緊進行軍機處檔冊及內閣部院檔部分之進行。

乙、官書

1. 聖訓，為清代太祖、太宗、世祖、聖祖與高宗五朝皇帝聖訓之稿本，計41冊。

2. 奏議，為清代歷朝官員向皇帝建議奏陳事務的奏議抄件，自順治朝下迄清末光緒年間，共計1,468冊。

3. 清代實錄，典藏清太祖天命至清穆宗同治末年實錄，內包含漢文本2,956冊、滿文本1,385冊、蒙文本33冊，各文本所藏朝代年分不一，總計4,374冊。

4. 起居注冊，紀錄清代皇帝公務生活與言行之官方文獻，內含康熙朝至光緒朝漢文本起居注冊3,677冊、滿文本起居注冊4,109冊，共計7,786冊。

5. 欽定剿捕三省邪匪方略，採紀事本末體，內容收錄清代嘉慶年間川楚陝三省爆發白蓮教動亂期間，清廷方面之軍事活動與動亂平定經過，全書分正編、續編及附編，計88冊。

6. 國榷，清初談遷（1594-1658）撰，為編年體史書，內容收錄明太祖建國至清初順治二年清兵攻陷南京止，全書104卷。院藏《國榷》為清史館抄本，存卷2至卷80，共79冊。

7. 夷務始末記，本書為記錄清末中央及地方處理涉外事務的官方文獻，院藏包括清《道光朝籌辦夷務始末記》28冊、《同治朝籌辦夷務始末記》20冊及《光緒朝籌辦夷務始末記》69冊，共117冊。

8. 宣統政紀，即宣統皇帝實錄，因其宣告退位，故改稱「政紀」，全書自宣統元年至三年，計67冊。

9. 內務府現行則例，計12冊。